以SARS-CoV、HIV、HBV和AIV 等病原引起的新發傳染病疾病模型開發、疫苗研制和疫苗評價為研究方向。 研制的靈長類AIDS和 SARS模型得到世界同行廣泛認可。研究所成為中國主要的人類傳染性疾病模型研制基地之一，也是多個AIDS相關的NIH研究項目參與實驗室。同法國科學院聯合開發的HIV治療疫苗是近5年世界上治療效果最好的疫苗之一。
SARS恒河猴模型是目前世界上目前最可靠的模型之一，相關工作有數篇發表在包括Nature medicine 在內的國際刊物上。研究成果榮獲2004年北京市科學技術獎二等獎， 2006年度國家科技進步獎二等獎，2006年度AFLAS-ICLAS 青年科學家獎。
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