由于近交系小鼠具有遺傳背景均一、實驗結果一致性好的優點,在使用小鼠作為我們研究基因功能或疾病機制的實驗動物時,近交系小鼠往往是我們的首選。需要注意的一點是:某些基因突變導致的表型在不同的近交系中可能有所不同。
常用的近交系小鼠有:
C57BL/6J
C57BL/6J 也叫 B6、B6J、Black 6 或 C57 Black,是使用最為廣泛的近交系小鼠,也是第一個完成基因組測序的品系。

來源:jax.org
C57BL/6J 近交系小鼠由 Clarence Cook Little 博士通過將 57 號雌鼠與 52 號雄鼠交配獲得,毛色為黑色。自發腫瘤較少,乳腺腫瘤自發率很低;對放射物耐受力中等;補體活性高;抗聽源性驚厥;骨密度較低;隨年齡增長會發生聽力障礙;高脂飲食誘導后易有肥胖表型、易發生 2 型糖尿病以及動脈粥樣硬化;小眼瞼炎及其他相關眼睛異常發生率高;有過度理毛行為,導致脫毛;偏好酒精和嗎啡;咬合錯位和腦積水發生率較高。
C57BL/6J 是目前最常用的基因工程小鼠模型、人類疾病小鼠模型、自發或誘導突變品系的遺傳背景,用于心血管生物學,發育生物學,糖尿病和肥胖,遺傳學,免疫學,神經生物學和感覺神經研究。
BALB/c
BALB/c 小鼠毛色為白色,被大家熟知主要是由于其在單克隆抗體與免疫學研究中的貢獻。BALB/c 小鼠對實驗性自身免疫性腦脊髓炎(EAE)和實驗性過敏性睪丸炎(EAO)具有抗性。對放射線極為敏感。乳腺癌發病率低,但隨著年齡增長,患其他癌癥(如肺癌和腎癌)的幾率大為增加。有一定數量的卵巢、腎上腺和肺部腫瘤、白血病的發生。
FVB 小鼠,毛色白色,起源于 Swiss 小鼠,1966 年起開始選育,在接種白日咳疫苗后,其中一系 HSFS/N 對組胺敏感。到 70 年代初 HSFS/N 系第 8 代中,發現攜帶Fv1b等位基因的小鼠對 B 型 Friend 白血病毒敏感,后將這些小鼠育成 Fv1b 同型合子近交系,故稱 FVB。由于 FVB 小鼠受精卵中的原核突出顯著且生產性能好、產仔數大,常用于轉基因顯微注射。FVB 小鼠自發腫瘤率低,但化學誘導易發鱗狀細胞癌。
遠交系
在一定群體內,以非近親交配方式育成的動物品系,且連續 15 代不從外部引入新的動物種群。