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在一項新的研究中，來自中國復旦大學、龍泉市疾病預防控制中心、武漢市疾病預防控制中心和溫州市疾病預防控制中心等研究機構的研究人員探究了毛茸茸的小型病毒載體如何影響病毒的傳播和進化。他們報告了669種病毒的鑒定結果，其中包括534種新型病毒，大大擴展了人們對哺乳動物病毒組（mammalian virome）---包括以前未知的冠狀病毒和正腮腺炎病毒（orthorubulavirus）---的了解。相關研究結果發表在2023年10月12日的Cell期刊上，論文標題為“Host traits shape virome composition and virus transmission in wild small mammals”。

在這項新的研究中，這些作者利用宏轉錄組測序技術對來自中國四個棲息地的2443只野生蝙蝠、嚙齒動物和鼩鼱的內臟器官和糞便樣本進行了測序。幾乎所有被研究的動物體內都發現了病毒。

這些作者發現了與已知人類或家養動物病原體---比如輪狀病毒 A、漢城病毒（Seoul virus）、溫州哺乳動物沙粒病毒（Wenzhou mammarenavirus）---相關的病毒，包括引起 SARS 和 COVID-19 等疾病的冠狀病毒。此外，還有新發現的正腮腺炎病毒、豬流行性腹瀉病毒（PEDV）、豬急性腹瀉綜合征冠狀病毒（SADS-CoV）以及與 SARS 相關的冠狀病毒。

這些作者提供了病毒跨物種傳播的有力證據。例如，在多種野生小型哺乳動物體內發現了病毒，這表明這些病毒可以在不同動物物種之間傳播，其中可能包括人類。

一種蝙蝠沙粒病毒的鑒定表明，沙粒病毒已使宿主從嚙齒動物轉移到蝙蝠。這一發現為這些病毒的進化提供了系統發育方面的啟示。

在一些病毒科---星狀病毒科（Astroviridae）、副粘病毒科（Paramyxoviridae）和小RNA病毒科（Picornaviridae）---中，這些作者發現了與已知序列相對不同的版本。

這些作者對蝙蝠、嚙齒動物和鼩鼱的病毒豐富程度進行了比較。他們發現，鼩鼱攜帶的病毒總數最多，在單一物種中發現的病毒也最多，在史密斯鼩鼱（Smith's shrews）體內發現了來自 29 個病毒支系的多達 150 種病毒。其中一些鼩鼱病毒與之前在無脊椎動物中發現的病毒有關，而另一些則截然不同。

圖片來自Cell, 2023, doi:10.1016/j.cell.2023.08.029。

這些作者在物種、屬、科和目分類水平上觀察到病毒的跨物種傳播，在三種或更多哺乳動物物種中發現了相同的病毒。在宿主體內多器官分布的病毒更有可能在其他宿主物種中發現。這表明如果一種病毒存在于多種內臟器官中，它就有更大的機會傳播到其他物種。

蝙蝠通常被認為比嚙齒動物攜帶更多的病毒。在這項新研究采樣的動物中，蝙蝠的病毒豐富度確實最高，其次是嚙齒動物和鼩鼱。雖然蝙蝠體內發現的病毒總數多于嚙齒類動物，但蝙蝠和嚙齒動物每種物種發現的病毒平均數量卻相差無幾。