目的為了解蝦源達卡氣單胞菌的毒力、耐藥基因分布和全基因組信息,并初步評估達卡氣單胞菌的致病性。
方法對蝦源分離株進行分子鑒定和多位點序列分型:利用B-溶血和胞外蛋白酶實驗、秀麗隱桿線液體毒性實驗、細胞毒實驗、小鼠實驗及毒力基因檢測研究其致病性:通過藥罐實驗及耐藥基因檢測分析其耐藥特征:利用eggnog、Prophage Hunter工具對全基因組序列進行分析。
結果菌株18FX22鑒定為達卡氣單胞菌。該菌的致病性主要表現:有一溶血能力和胞外蛋白酶活性:對秀麗隱桿線蟲、小鼠成纖維細胞和小鼠均有致病性。經檢測,該菌攜帶7種毒力基因和12種耐藥基因,發現其對阿莫西林/克拉維酸,頭孢座林和多粘菌素3種藥物有耐藥性。全基因組測序結果 發現:18FX22的全基因組大小為4811079bp,GC含量為61.33%。C0G注釋發現18FX22共有3850個基因,具有20類功能。前噬菌體預測結果 發現18FX22的基因組中含有2個前噬菌體序列。全球達卡氣單胞菌的聚類結果 顯示該菌與GCA016729585的進化關系更近。
結論本研究從商品蝦分離出達卡氣單胞菌,發現該菌株的毒性較強,指示應加強海鮮食品安全的管控,并為達卡氣單胞菌的防治提供參考。
閱讀原文:蝦源達卡氣單胞菌全基因組分析和致病性研究.pdf